由于屋顶的生态环境与地面有明显的不同，光照、温度、湿度、风力等随着层高的增加而呈现不同的变化，比如屋顶太阳辐射强、升温快、暴冷暴热、昼夜温差大等。所以需要根据各类植物生长特性，选择适合屋顶生长环境的植物品种。宜选择耐寒、耐热、耐旱、耐瘠、生命力旺盛的花草树木。由于屋顶风力较大，种植土较轻，对植物的固定力小，因此不宜种植高大植物。屋顶花园土层薄，为保证植物成活，尽量采用袋栽苗或盆栽苗。对于较大的树木采用砌筑花池的方式和局部微地形处理，以保证植物对土层厚度的正常要求。适合屋顶花园的植物品种有很多，但植物配置上要遵循一定的原则。其中花灌木类是建造屋顶花园的主体，应尽量实现四季花卉的搭配。如春天的马齿苋树、玉树，叶仙人掌、长寿花，银苞芋、万年青;夏天的石榴、月季，榕树、棒兰、龙舌兰;秋天的紫薇、石榴、一品红、含笑，冬天的红叶李、垂丝海棠，枸骨、冬青等。

镶边植物在屋顶花园应用非常广泛，在花坛周围或乔木、灌木之下，栽一些镶边植物很有韵味，同时也充分利用了坛边地角，镶边植物可用麦冬、小叶女贞等，这样可以避免产生底层、边角效果，少留裸土、空白。

屋顶花园的墙面绿化通常利用有卷须、钩刺等吸附、缠绕、攀缘性植物，使其在各种垂直墙面上快速生长，爬山虎、紫藤、万年青等植物价廉物美，有一定观赏性，可作首选。也可选用其他花草、植物垂吊墙面。如紫藤、葡萄、爬藤蔷薇、牵牛花等。